Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAP7

Asf1b, Histone chaperone ASF1B, mousemouse

Predictions only

Length 202 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Asf1bQ9DAP7 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Asf1bQ9DAP7 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Asf1bQ9DAP7 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Asf1bQ9DAP7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Asf1bQ9DAP7 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Asf1bQ9DAP7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Asf1bQ9DAP7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.5 ms