Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA37

Samd8, Sphingomyelin synthase-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 478 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Samd8Q9DA37 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Samd8Q9DA37 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Samd8Q9DA37 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Samd8Q9DA37 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Samd8Q9DA37 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.32■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.31■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Samd8Q9DA37 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Samd8Q9DA37 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Samd8Q9DA37 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 115.4 ms