Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9K8

Iqcf1, IQ domain-containing protein F1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Iqcf1Q9D9K8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Iqcf1Q9D9K8 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Iqcf1Q9D9K8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.78■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Iqcf1Q9D9K8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Iqcf1Q9D9K8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Iqcf1Q9D9K8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Iqcf1Q9D9K8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iqcf1Q9D9K8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iqcf1Q9D9K8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iqcf1Q9D9K8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iqcf1Q9D9K8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Iqcf1Q9D9K8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Iqcf1Q9D9K8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Iqcf1Q9D9K8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms