Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8C4

Ifi35, Interferon-induced 35 kDa protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifi35Q9D8C4 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifi35Q9D8C4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Ifi35Q9D8C4 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Ifi35Q9D8C4 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ifi35Q9D8C4 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Ifi35Q9D8C4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Ifi35Q9D8C4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 Tmem240-201ENSMUST00000127188 1308 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Ifi35Q9D8C4 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Ifi35Q9D8C4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC26.38■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ifi35Q9D8C4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ifi35Q9D8C4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.79
Ifi35Q9D8C4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Kcnmb4os2-201ENSMUST00000080943 1571 ntTSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ifi35Q9D8C4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC26.12■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Ifi35Q9D8C4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.2 ms