Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B7

Jam3, Junctional adhesion molecule C, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Jam3Q9D8B7 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.59■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Jam3Q9D8B7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC21.53■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Jam3Q9D8B7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Jam3Q9D8B7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Jam3Q9D8B7 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Jam3Q9D8B7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Jam3Q9D8B7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Jam3Q9D8B7 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.5 ms