Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7J9

Echdc3, Enoyl-CoA hydratase domain-containing protein 3, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 300 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Echdc3Q9D7J9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Echdc3Q9D7J9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Echdc3Q9D7J9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Echdc3Q9D7J9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Echdc3Q9D7J9 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Echdc3Q9D7J9 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Echdc3Q9D7J9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Echdc3Q9D7J9 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.2 ms