Protein–RNA interactions for Protein: Q9D727

Uncharacterized protein C6orf226 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D727 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D727 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.39
Q9D727 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D727 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D727 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D727 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D727 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D727 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D727 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
Q9D727 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D727 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.5■□□□□ 0.39
Q9D727 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D727 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D727 Tprgl-202ENSMUST00000105639 642 ntTSL 5 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D727 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D727 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.49■□□□□ 0.39
Q9D727 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D727 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D727 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D727 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D727 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D727 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D727 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
Q9D727 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D727 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
Q9D727 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D727 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
Q9D727 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D727 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC17.45■□□□□ 0.38
Q9D727 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D727 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.44■□□□□ 0.38
Q9D727 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D727 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D727 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D727 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
Q9D727 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D727 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
Q9D727 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D727 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
Q9D727 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D727 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D727 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D727 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
Q9D727 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D727 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Q9D727 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D727 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D727 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D727 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D727 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D727 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D727 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D727 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Q9D727 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D727 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D727 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D727 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D727 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Q9D727 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D727 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D727 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D727 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Q9D727 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D727 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D727 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D727 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D727 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D727 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Q9D727 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D727 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
Q9D727 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D727 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D727 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Q9D727 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D727 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D727 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Q9D727 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D727 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D727 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D727 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Q9D727 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D727 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D727 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D727 Fgf2-204ENSMUST00000138563 1240 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D727 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D727 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D727 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D727 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Q9D727 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Q9D727 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D727 Syce2-204ENSMUST00000170296 929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D727 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D727 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D727 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Q9D727 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D727 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D727 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D727 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
Q9D727 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
Q9D727 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 131.2 ms