Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y4

Borcs8, BLOC-1-related complex subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Borcs8Q9D6Y4 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Borcs8Q9D6Y4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Borcs8Q9D6Y4 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Borcs8Q9D6Y4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Borcs8Q9D6Y4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Borcs8Q9D6Y4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Borcs8Q9D6Y4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms