Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Fundc2Q9D6K8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Fundc2Q9D6K8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Fundc2Q9D6K8 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fundc2Q9D6K8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Fundc2Q9D6K8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc2Q9D6K8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc2Q9D6K8 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc2Q9D6K8 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc2Q9D6K8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Fundc2Q9D6K8 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Fundc2Q9D6K8 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC21.93■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Fundc2Q9D6K8 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Fundc2Q9D6K8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Fundc2Q9D6K8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.7 ms