Protein–RNA interactions for Protein: Q9D5V6

Syap1, Synapse-associated protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syap1Q9D5V6 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Syap1Q9D5V6 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.21■■□□□ 1.63
Syap1Q9D5V6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC25.17■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Syap1Q9D5V6 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Syap1Q9D5V6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Syap1Q9D5V6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Syap1Q9D5V6 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Syap1Q9D5V6 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms