Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Lonrf3Q9D4H7 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC28.36■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC28.34■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC28.33■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Lonrf3Q9D4H7 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Lonrf3Q9D4H7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.11
Lonrf3Q9D4H7 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Lonrf3Q9D4H7 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Lonrf3Q9D4H7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Cldnd1-201ENSMUST00000023426 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
Lonrf3Q9D4H7 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
Lonrf3Q9D4H7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC27.99■■■□□ 2.07
Lonrf3Q9D4H7 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.99■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.5 ms