Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC26.59■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
Cfap53Q9D439 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Cfap53Q9D439 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC26.5■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Cfap53Q9D439 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Cfap53Q9D439 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Cfap53Q9D439 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Cfap53Q9D439 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Cfap53Q9D439 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Cfap53Q9D439 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfap53Q9D439 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Cfap53Q9D439 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Cfap53Q9D439 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Cfap53Q9D439 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Cfap53Q9D439 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.14■■□□□ 1.78
Cfap53Q9D439 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Cfap53Q9D439 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms