Protein–RNA interactions for Protein: Q9D350

Obox1, OBOX1, mousemouse

Predictions only

Length 204 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Obox1Q9D350 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox1Q9D350 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox1Q9D350 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox1Q9D350 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Obox1Q9D350 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox1Q9D350 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox1Q9D350 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Obox1Q9D350 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
Obox1Q9D350 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.08■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Obox1Q9D350 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Obox1Q9D350 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Obox1Q9D350 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Obox1Q9D350 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
Obox1Q9D350 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
Obox1Q9D350 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 1084.6 ms