Protein–RNA interactions for Protein: Q9D226

Krtap5-3, Keratin-associated protein 5-3, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krtap5-3Q9D226 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Krtap5-3Q9D226 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Krtap5-3Q9D226 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Krtap5-3Q9D226 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC27.26■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC27.22■■□□□ 1.95
Krtap5-3Q9D226 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.94
Krtap5-3Q9D226 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
Krtap5-3Q9D226 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krtap5-3Q9D226 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krtap5-3Q9D226 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Krtap5-3Q9D226 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krtap5-3Q9D226 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Krtap5-3Q9D226 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Krtap5-3Q9D226 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Krtap5-3Q9D226 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Krtap5-3Q9D226 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Krtap5-3Q9D226 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC26.91■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Krtap5-3Q9D226 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.87■■□□□ 1.89
Krtap5-3Q9D226 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.87■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 114.8 ms