Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0I6

Wdsub1, WD repeat, SAM and U-box domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdsub1Q9D0I6 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdsub1Q9D0I6 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Wdsub1Q9D0I6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdsub1Q9D0I6 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdsub1Q9D0I6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Wdsub1Q9D0I6 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Wdsub1Q9D0I6 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Wdsub1Q9D0I6 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Wdsub1Q9D0I6 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Wdsub1Q9D0I6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Wdsub1Q9D0I6 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Wdsub1Q9D0I6 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.1 ms