Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0C4

Trmt5, tRNA (guanine(37)-N1)-methyltransferase, mousemouse

Predictions only

Length 501 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trmt5Q9D0C4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Trmt5Q9D0C4 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt5Q9D0C4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt5Q9D0C4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Trmt5Q9D0C4 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Trmt5Q9D0C4 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Trmt5Q9D0C4 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
Trmt5Q9D0C4 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Trmt5Q9D0C4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trmt5Q9D0C4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trmt5Q9D0C4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms