Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZ83

Mrpl55, 39S ribosomal protein L55, mitochondrial, mousemouse

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Length 127 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mrpl55Q9CZ83 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
Mrpl55Q9CZ83 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC15.7■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Ssbp3-203ENSMUST00000097934 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Jag1-201ENSMUST00000028735 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.69■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.68■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
Mrpl55Q9CZ83 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Neurl4-213ENSMUST00000177476 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Sptbn4-201ENSMUST00000011895 8747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Nectin1-201ENSMUST00000034510 5653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Mrpl55Q9CZ83 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Raly-203ENSMUST00000109701 1709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Rbfox2-201ENSMUST00000048145 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Mrpl55Q9CZ83 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Nova2-202ENSMUST00000220302 8372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Nova2-201ENSMUST00000032571 8372 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Mrpl55Q9CZ83 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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