Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYB0

Trim13, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM13, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trim13Q9CYB0 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Trim13Q9CYB0 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Trim13Q9CYB0 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Trim13Q9CYB0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Homer3-202ENSMUST00000087467 880 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Trim13Q9CYB0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Trim13Q9CYB0 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
Trim13Q9CYB0 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.6 ms