Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYA6

Zcchc8, Zinc finger CCHC domain-containing protein 8, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 709 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zcchc8Q9CYA6 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Zcchc8Q9CYA6 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.03■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Zcchc8Q9CYA6 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Zcchc8Q9CYA6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Zcchc8Q9CYA6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Zcchc8Q9CYA6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
Zcchc8Q9CYA6 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Zcchc8Q9CYA6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms