Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX56

Psmd8, 26S proteasome non-ATPase regulatory subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmd8Q9CX56 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Psmd8Q9CX56 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Psmd8Q9CX56 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Psmd8Q9CX56 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd8Q9CX56 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Psmd8Q9CX56 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd8Q9CX56 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Psmd8Q9CX56 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Psmd8Q9CX56 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Psmd8Q9CX56 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Psmd8Q9CX56 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Psmd8Q9CX56 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Psmd8Q9CX56 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Psmd8Q9CX56 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Psmd8Q9CX56 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms