Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWX2

Ndufaf1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 328 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufaf1Q9CWX2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Ndufaf1Q9CWX2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Ndufaf1Q9CWX2 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Ndufaf1Q9CWX2 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Ndufaf1Q9CWX2 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Ndufaf1Q9CWX2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ndufaf1Q9CWX2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ndufaf1Q9CWX2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 208 ms