Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWS4

Ints11, Integrator complex subunit 11, mousemouse

Predictions only

Length 600 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ints11Q9CWS4 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ints11Q9CWS4 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Ints11Q9CWS4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.78■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ints11Q9CWS4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Ints11Q9CWS4 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.22
Ints11Q9CWS4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Ints11Q9CWS4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Ints11Q9CWS4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms