Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUS9

Sppl3, Signal peptide peptidase-like 3, mousemouse

Predictions only

Length 384 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sppl3Q9CUS9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.27■■□□□ 1.96
Sppl3Q9CUS9 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC27.23■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Sppl3Q9CUS9 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Sppl3Q9CUS9 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.13■■□□□ 1.93
Sppl3Q9CUS9 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.12■■□□□ 1.93
Sppl3Q9CUS9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC27.1■■□□□ 1.93
Sppl3Q9CUS9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sppl3Q9CUS9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Sppl3Q9CUS9 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Sppl3Q9CUS9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Sppl3Q9CUS9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC27.01■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
Sppl3Q9CUS9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.91■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Sppl3Q9CUS9 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.88■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 Gm6206-201ENSMUST00000133472 2199 ntBASIC26.88■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.85■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC26.83■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Sppl3Q9CUS9 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC26.82■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC26.81■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Sppl3Q9CUS9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.8■■□□□ 1.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.6 ms