Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUJ8

4930519P11Rik, RIKEN cDNA 4930519P11 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930519P11RikQ9CUJ8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
4930519P11RikQ9CUJ8 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
4930519P11RikQ9CUJ8 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC16.08■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
4930519P11RikQ9CUJ8 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC16■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
4930519P11RikQ9CUJ8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.1 ms