Protein–RNA interactions for Protein: Q9CUH1

4930553M12Rik, RIKEN cDNA 4930553M12 gene (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 165 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4930553M12RikQ9CUH1 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.89■■□□□ 1.26
4930553M12RikQ9CUH1 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
4930553M12RikQ9CUH1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
4930553M12RikQ9CUH1 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 AC150314.2-201ENSMUST00000214135 834 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
4930553M12RikQ9CUH1 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
4930553M12RikQ9CUH1 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
4930553M12RikQ9CUH1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms