Protein–RNA interactions for Protein: Q9CU62

Smc1a, Structural maintenance of chromosomes protein 1A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smc1aQ9CU62 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Smc1aQ9CU62 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC26.74■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.73■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Smc1aQ9CU62 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC26.66■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC26.65■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
Smc1aQ9CU62 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
Smc1aQ9CU62 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
Smc1aQ9CU62 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC26.48■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
Smc1aQ9CU62 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC26.44■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
Smc1aQ9CU62 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms