Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9CRC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9CRC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q9CRC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CRC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CRC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CRC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 8.5 ms