Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9CRC3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Q9CRC3 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Q9CRC3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.35■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Tmed7-201ENSMUST00000036030 1436 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Q9CRC3 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Drap1-201ENSMUST00000025853 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Bod1-201ENSMUST00000058060 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Q9CRC3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.27■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CRC3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.23■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.22■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.21■□□□□ 0.67
Q9CRC3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.2■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.19■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.18■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CRC3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CRC3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Q9CRC3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Q9CRC3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
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