Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRB4

1700029F12Rik, RIKEN cDNA 1700029F12 gene, mousemouse

Predictions only

Length 147 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
1700029F12RikQ9CRB4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC19.58■□□□□ 0.73
1700029F12RikQ9CRB4 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.58■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC19.57■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC19.56■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC19.55■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.54■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC19.53■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.52■□□□□ 0.72
1700029F12RikQ9CRB4 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.51■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC19.5■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.49■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.48■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Gm12339-201ENSMUST00000127424 728 ntTSL 3 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Uhrf2-202ENSMUST00000112552 1464 ntTSL 1 (best) BASIC19.47■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.46■□□□□ 0.71
1700029F12RikQ9CRB4 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC19.45■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC19.44■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 AL845457.1-201ENSMUST00000197244 68 ntBASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.4■□□□□ 0.7
1700029F12RikQ9CRB4 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Dapk3-209ENSMUST00000219850 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
1700029F12RikQ9CRB4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.7 ms