Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQQ7

Atp5f1, ATP synthase F(0) complex subunit B1, mitochondrial, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Atp5f1Q9CQQ7 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Atp5f1Q9CQQ7 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Atp5f1Q9CQQ7 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Atp5f1Q9CQQ7 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Atp5f1Q9CQQ7 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Atp5f1Q9CQQ7 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 87.2 ms