Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQI9

Med30, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 30, mousemouse

Predictions only

Length 178 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med30Q9CQI9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Med30Q9CQI9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Med30Q9CQI9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Med30Q9CQI9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Med30Q9CQI9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.4■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC20.39■□□□□ 0.86
Med30Q9CQI9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.39■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Med30Q9CQI9 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC20.36■□□□□ 0.85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.9 ms