Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQF4 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQF4 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQF4 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQF4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Q9CQF4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQF4 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Q9CQF4 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQF4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Q9CQF4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQF4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQF4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Q9CQF4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Q9CQF4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQF4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Q9CQF4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQF4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQF4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Q9CQF4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms