Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQA3

Sdhb, Succinate dehydrogenase [ubiquinone] iron-sulfur subunit, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SdhbQ9CQA3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Cadm4-201ENSMUST00000068023 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
SdhbQ9CQA3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.93■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Ccm2l-201ENSMUST00000109800 2158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
SdhbQ9CQA3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.89■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Gm22567-201ENSMUST00000175542 342 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.86■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Ccz1-201ENSMUST00000031621 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Gm12100-201ENSMUST00000150255 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC24.83■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
SdhbQ9CQA3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
SdhbQ9CQA3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SdhbQ9CQA3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC24.81■■□□□ 1.56
SdhbQ9CQA3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
SdhbQ9CQA3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdhbQ9CQA3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.79■■□□□ 1.56
SdhbQ9CQA3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC24.79■■□□□ 1.56
SdhbQ9CQA3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.77■■□□□ 1.56
SdhbQ9CQA3 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Pwwp2a-202ENSMUST00000094294 1814 ntTSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
SdhbQ9CQA3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.68■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Ube2ql1-201ENSMUST00000065118 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
SdhbQ9CQA3 Gltp-201ENSMUST00000012028 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms