Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ82

Itgb3bp, Centromere protein R, mousemouse

Predictions only

Length 176 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb3bpQ9CQ82 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.14
Itgb3bpQ9CQ82 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Itgb3bpQ9CQ82 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Terf2-201ENSMUST00000068388 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Itgb3bpQ9CQ82 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Itgb3bpQ9CQ82 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Itgb3bpQ9CQ82 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Itgb3bpQ9CQ82 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.8 ms