Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ02

Commd4, COMM domain-containing protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Commd4Q9CQ02 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Commd4Q9CQ02 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.02
Commd4Q9CQ02 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.37■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Commd4Q9CQ02 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Commd4Q9CQ02 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Commd4Q9CQ02 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.6 ms