Protein–RNA interactions for Protein: Q99NB5

Gsdmc, Gasdermin-C, mousemouse

Predictions only

Length 468 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GsdmcQ99NB5 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
GsdmcQ99NB5 Orai1-201ENSMUST00000051016 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
GsdmcQ99NB5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
GsdmcQ99NB5 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
GsdmcQ99NB5 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
GsdmcQ99NB5 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.1■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
GsdmcQ99NB5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GsdmcQ99NB5 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
GsdmcQ99NB5 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GsdmcQ99NB5 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
GsdmcQ99NB5 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GsdmcQ99NB5 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
GsdmcQ99NB5 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.1 ms