Protein–RNA interactions for Protein: Q99MR8

Mccc1, Methylcrotonoyl-CoA carboxylase subunit alpha, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 717 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mccc1Q99MR8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Mccc1Q99MR8 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Mccc1Q99MR8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Mccc1Q99MR8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mccc1Q99MR8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mccc1Q99MR8 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Mccc1Q99MR8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mccc1Q99MR8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Mccc1Q99MR8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Mccc1Q99MR8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
Mccc1Q99MR8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Mccc1Q99MR8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mccc1Q99MR8 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Mccc1Q99MR8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Mccc1Q99MR8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mccc1Q99MR8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Mccc1Q99MR8 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Mccc1Q99MR8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Mccc1Q99MR8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Mccc1Q99MR8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Mccc1Q99MR8 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Mccc1Q99MR8 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.9 ms