Protein–RNA interactions for Protein: Q99MN9

Pccb, Propionyl-CoA carboxylase beta chain, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PccbQ99MN9 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC21.33■■□□□ 1.01
PccbQ99MN9 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC21.27■■□□□ 1
PccbQ99MN9 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
PccbQ99MN9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC21.17■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
PccbQ99MN9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC21.11■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.1■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
PccbQ99MN9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.07■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC21.06■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.03■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
PccbQ99MN9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
PccbQ99MN9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.3 ms