Protein–RNA interactions for Protein: Q99LU0

Chmp1b1, Charged multivesicular body protein 1b-1, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp1b1Q99LU0 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Chmp1b1Q99LU0 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Chmp1b1Q99LU0 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Chmp1b1Q99LU0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Chmp1b1Q99LU0 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Chmp1b1Q99LU0 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms