Protein–RNA interactions for Protein: Q99LM2

Cdk5rap3, CDK5 regulatory subunit-associated protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cdk5rap3Q99LM2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Cdk5rap3Q99LM2 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Cdk5rap3Q99LM2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Cdk5rap3Q99LM2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.98■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Cdk5rap3Q99LM2 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Cdk5rap3Q99LM2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Cdk5rap3Q99LM2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap3Q99LM2 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Cdk5rap3Q99LM2 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap3Q99LM2 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Cdk5rap3Q99LM2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap3Q99LM2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Cdk5rap3Q99LM2 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.89■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Cdk5rap3Q99LM2 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.8■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
Cdk5rap3Q99LM2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Cdk5rap3Q99LM2 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms