Protein–RNA interactions for Protein: Q99L48

Nmd3, 60S ribosomal export protein NMD3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nmd3Q99L48 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Tnfsf12-202ENSMUST00000181810 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Mapk14-205ENSMUST00000114758 1581 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Nmd3Q99L48 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Nmd3Q99L48 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.19
Nmd3Q99L48 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Kctd9-204ENSMUST00000150768 1302 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Nmd3Q99L48 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Nmd3Q99L48 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 234.8 ms