Protein–RNA interactions for Protein: Q924N9

Prss28, Serine protease 28, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prss28Q924N9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Rpia-201ENSMUST00000066134 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Prss28Q924N9 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Prss28Q924N9 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Prss28Q924N9 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Fndc10-201ENSMUST00000099265 2140 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Tprgl-201ENSMUST00000030896 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Azin2-201ENSMUST00000030581 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Prss28Q924N9 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Prelid3b-201ENSMUST00000016401 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Ccm2-201ENSMUST00000000388 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Tlx1-201ENSMUST00000026236 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Mocs3-201ENSMUST00000099071 1973 ntAPPRIS P1 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Prss28Q924N9 Frs3-201ENSMUST00000113296 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC22.58■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Orai1-202ENSMUST00000121652 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Cited1-202ENSMUST00000101336 1090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Prss28Q924N9 Msantd2-201ENSMUST00000048604 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss28Q924N9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss28Q924N9 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Prss28Q924N9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Prss28Q924N9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms