Protein–RNA interactions for Protein: Q920N1

Odf3, Outer dense fiber protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Odf3Q920N1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Odf3Q920N1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Odf3Q920N1 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Odf3Q920N1 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC18.08■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Odf3Q920N1 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Odf3Q920N1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Odf3Q920N1 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms