Protein–RNA interactions for Protein: Q920E5

Fdps, Farnesyl pyrophosphate synthase, mousemouse

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FdpsQ920E5 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC25.02■■□□□ 1.6
FdpsQ920E5 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
FdpsQ920E5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Nrep-202ENSMUST00000168890 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC24.9■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
FdpsQ920E5 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.85■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
FdpsQ920E5 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.83■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.82■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.81■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC24.78■■□□□ 1.56
FdpsQ920E5 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
FdpsQ920E5 Rpl19-ps4-201ENSMUST00000167150 625 ntBASIC24.7■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.68■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
FdpsQ920E5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
FdpsQ920E5 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
FdpsQ920E5 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
FdpsQ920E5 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.1 ms