Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZZ3

Sncb, Beta-synuclein, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SncbQ91ZZ3 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Spata1-201ENSMUST00000029839 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
SncbQ91ZZ3 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
SncbQ91ZZ3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
SncbQ91ZZ3 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC23.84■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Mbd3-204ENSMUST00000105349 1566 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
SncbQ91ZZ3 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Fcho2-204ENSMUST00000179563 1586 ntTSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.78■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
SncbQ91ZZ3 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Aes-201ENSMUST00000002518 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Ppp2cb-201ENSMUST00000009774 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
SncbQ91ZZ3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.3 ms