Protein–RNA interactions for Protein: Q91V10

Vsx1, Visual system homeobox 1, mousemouse

Predictions only

Length 363 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vsx1Q91V10 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Vsx1Q91V10 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Vsx1Q91V10 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsx1Q91V10 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Vsx1Q91V10 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsx1Q91V10 Ppp2r2d-201ENSMUST00000041097 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Vsx1Q91V10 Suds3-202ENSMUST00000166397 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Vsx1Q91V10 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Adgrb2-207ENSMUST00000120204 5170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Nectin3-203ENSMUST00000096052 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Tgfbr1-205ENSMUST00000126171 1829 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Vsx1Q91V10 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Ldb1-206ENSMUST00000152946 2108 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Raly-204ENSMUST00000116389 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Rab7-204ENSMUST00000113598 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vsx1Q91V10 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vsx1Q91V10 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Raly-202ENSMUST00000058089 1747 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Rhobtb3-202ENSMUST00000109606 1676 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.04■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 C530008M17Rik-201ENSMUST00000086909 1844 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vsx1Q91V10 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Tmem59-201ENSMUST00000030361 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vsx1Q91V10 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Hexdc-202ENSMUST00000106117 2149 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vsx1Q91V10 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vsx1Q91V10 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vsx1Q91V10 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vsx1Q91V10 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vsx1Q91V10 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vsx1Q91V10 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vsx1Q91V10 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.7 ms