Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIM4

Bsnd, Barttin, mousemouse

Predictions only

Length 307 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BsndQ8VIM4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BsndQ8VIM4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
BsndQ8VIM4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BsndQ8VIM4 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
BsndQ8VIM4 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.83■■□□□ 1.41
BsndQ8VIM4 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
BsndQ8VIM4 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
BsndQ8VIM4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.75■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.71■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
BsndQ8VIM4 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
BsndQ8VIM4 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
BsndQ8VIM4 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.58■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.55■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
BsndQ8VIM4 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
BsndQ8VIM4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BsndQ8VIM4 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BsndQ8VIM4 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BsndQ8VIM4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
BsndQ8VIM4 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
BsndQ8VIM4 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.9 ms