Protein–RNA interactions for Protein: Q8VIJ6

Sfpq, Splicing factor, proline- and glutamine-rich, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 699 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SfpqQ8VIJ6 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.48■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.67
SfpqQ8VIJ6 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
SfpqQ8VIJ6 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC25.39■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SfpqQ8VIJ6 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SfpqQ8VIJ6 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SfpqQ8VIJ6 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
SfpqQ8VIJ6 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms