Protein–RNA interactions for Protein: Q8VHC3

Selenom, Selenoprotein M, mousemouse

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenomQ8VHC3 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
SelenomQ8VHC3 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
SelenomQ8VHC3 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
SelenomQ8VHC3 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC22.64■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
SelenomQ8VHC3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SelenomQ8VHC3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC22.51■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SelenomQ8VHC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
SelenomQ8VHC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.1 ms