Protein–RNA interactions for Protein: Q8VEJ9

Vps4a, Vacuolar protein sorting-associated protein 4A, mousemouse

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps4aQ8VEJ9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Vps4aQ8VEJ9 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Cldn10-203ENSMUST00000100314 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Vps4aQ8VEJ9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps4aQ8VEJ9 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Vps4aQ8VEJ9 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Vps4aQ8VEJ9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4aQ8VEJ9 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Vps4aQ8VEJ9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Vps4aQ8VEJ9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps4aQ8VEJ9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Vps4aQ8VEJ9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Vps4aQ8VEJ9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Vps4aQ8VEJ9 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Rtn4r-201ENSMUST00000059589 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps4aQ8VEJ9 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps4aQ8VEJ9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.6 ms