Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBY2

Camkk1, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 1, mousemouse

Predictions only

Length 505 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Camkk1Q8VBY2 Tcfl5-201ENSMUST00000037877 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Camkk1Q8VBY2 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Camkk1Q8VBY2 Ildr2-207ENSMUST00000195557 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Camkk1Q8VBY2 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC25.84■■□□□ 1.73
Camkk1Q8VBY2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Camkk1Q8VBY2 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Camkk1Q8VBY2 Six3-202ENSMUST00000175898 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC25.8■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Tspan3-201ENSMUST00000034876 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
Camkk1Q8VBY2 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC25.76■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Camkk1Q8VBY2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Camkk1Q8VBY2 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 Fcnaos-201ENSMUST00000127642 1351 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Camkk1Q8VBY2 Phf10-201ENSMUST00000024657 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Camkk1Q8VBY2 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Gm2415-204ENSMUST00000190235 2004 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Hspd1-201ENSMUST00000027123 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Pdia5-201ENSMUST00000023550 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Ctbp1-206ENSMUST00000201575 2091 ntTSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Camkk1Q8VBY2 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Brsk2-203ENSMUST00000078200 2363 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Camkk1Q8VBY2 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Gjc1-201ENSMUST00000068933 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Camkk1Q8VBY2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.4 ms